| Kode Mata Kuliah | BI2105 / 2 SKS |
|---|
| Penyelenggara | 106 - Biologi / SITH |
|---|
| Kategori | Kuliah |
|---|
| Bahasa Indonesia | English |
|---|
| Nama Mata Kuliah | Pengantar Bioinformatika untuk Biologi | Introduction to Bioinformatics for Biologist |
|---|
| Bahan Kajian | - Pengantar Bioinformatika: Revolusi data biologi, big data, definisi bioinformatika
- Database dalam bioinformatika
- Penjajaran urutan DNA/protein
- Analisis filogenetika molekuler
- Anotasi genom dan prediksi struktur gen dan elemen regulator
- Analisis stuktur RNA dan prediksi struktur protein
- Analisis data bioinformatika menggunakan bahasa pemrograman Linux, R dan Phyton
- Kecerdasan buatan dalam bioinformatika
| - Introduction to Bioinformatics: The Biological Data Revolution, Big Data, and the Definition of Bioinformatics
- Databases in Bioinformatics
- DNA/protein sequence alignment
- Molecular phylogenetic analysis
- Genome annotation and prediction of gene structures and regulatory elements
- RNA structure analysis and protein structure prediction
- Bioinformatics data analysis using the Linux, R, and Python programming languages
- Artificial Intelligence in Bioinformatics
|
|---|
| Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK) | - Mahasiswa mampu menggunakan keilmuan dan kemampuan praktis bioinformatika dalam memecahkan masalah biologi. (CPL 01, CPL 13)
- Mahasiswa mampu menggunakan berbagai macam program analisis bioinformatika dengan tepat dan dapat mengaplikasikan pada bidang terkait penelitian biologi. (CPL 03, CPL 08, CPL 10, CPL 13)
- Mahasiswa memahami dapat memilih dan menggunakan database DNA, RNA, Protein dan Metabolit dan dapat mengaplikasikan pada penelitian terkait biologi. (CPL 01, CPL 08)
- Mahasiswa memahami konsep dasar penjajaran sekuen dan dapat mengaplikasikannya secara tepat. (CPL 01, CPL 08)
- Mahasiswa mampu membangun pohon filogenetik dan mengintepretasikan hasil konstruksi pohon. (CPL 01, CPL 08)
- Mahasiswa mampu memahami dan mengevaluasi relasi struktur dan fungsi dari suatu sekuens pada molekul RNA/Protein serta memprediksi stuktur protein. (CPL 08)
- Mahasiswa mampu menggunakan bahasa pemrograman berbasis linux, R dan Python dalam mengolah data terkait bioinformatika. (CPL 08, CPL 10)
| - Students are able to apply their knowledge and practical skills in bioinformatics to solve biological problems. (CPL 01, CPL 13)
- Students are able to use a variety of bioinformatics analysis programs appropriately and apply them to relevant fields of biological research. (CPL 03, CPL 08, CPL 10, CPL 13)
- Students will be able to select and use DNA, RNA, protein, and metabolite databases and apply them to biology-related research. (CPL 01, CPL 08)
- Students understand the basic concepts of sequence alignment and can apply them correctly. (CPL 01, CPL 08)
- Students are able to construct phylogenetic trees and interpret the results of tree construction. (CPL 01, CPL 08)
- Students are able to understand and evaluate the structure-function relationship of a sequence in an RNA or protein molecule and predict protein structures. (CPL 08)
- Students are able to use Linux-based programming languages, R, and Python to process bioinformatics-related data. (CPL 08, CPL 10)
|
|---|
| Metode Pembelajaran | Proses belajar (ceramah dan diskusi) di dalam kelas, Penugasan terstruktur, Kegiatan mandiri | In-class learning activities (lectures and discussions), structured assignments, independent activities |
|---|
| Modalitas Pembelajaran | Moda penyerapan: Visual, Auditorial
Moda Pelaksanaan: Sinkronous dan Asinkronous | Learning Styles: Visual, Auditory
Delivery Methods: Synchronous and Asynchronous |
|---|
| Jenis Nilai | ABCDE |
|---|
| Metode Penilaian | UTS 30%; UAS 30%; Praktikum 30%; kuis 5%; makalah dan presentasi proyek kelompok 5% | Midterm Exam 30%; Final Exam 30%; Lab 30%; quizzes 5%; term paper and group project presentation 5% |
|---|
| Catatan Tambahan | | |
|---|