Kode Mata KuliahBI2105 / 2 SKS
Penyelenggara106 - Biologi / SITH
KategoriKuliah
Bahasa IndonesiaEnglish
Nama Mata KuliahPengantar Bioinformatika untuk BiologiIntroduction to Bioinformatics for Biologist
Bahan Kajian
  1. Pengantar Bioinformatika: Revolusi data biologi, big data, definisi bioinformatika
  2. Database dalam bioinformatika
  3. Penjajaran urutan DNA/protein
  4. Analisis filogenetika molekuler
  5. Anotasi genom dan prediksi struktur gen dan elemen regulator
  6. Analisis stuktur RNA dan prediksi struktur protein
  7. Analisis data bioinformatika menggunakan bahasa pemrograman Linux, R dan Phyton
  8. Kecerdasan buatan dalam bioinformatika
  1. Introduction to Bioinformatics: The Biological Data Revolution, Big Data, and the Definition of Bioinformatics
  2. Databases in Bioinformatics
  3. DNA/protein sequence alignment
  4. Molecular phylogenetic analysis
  5. Genome annotation and prediction of gene structures and regulatory elements
  6. RNA structure analysis and protein structure prediction
  7. Bioinformatics data analysis using the Linux, R, and Python programming languages
  8. Artificial Intelligence in Bioinformatics
Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK)
  1. Mahasiswa mampu menggunakan keilmuan dan kemampuan praktis bioinformatika dalam memecahkan masalah biologi. (CPL 01, CPL 13)
  2. Mahasiswa mampu menggunakan berbagai macam program analisis bioinformatika dengan tepat dan dapat mengaplikasikan pada bidang terkait penelitian biologi. (CPL 03, CPL 08, CPL 10, CPL 13)
  3. Mahasiswa memahami dapat memilih dan menggunakan database DNA, RNA, Protein dan Metabolit dan dapat mengaplikasikan pada penelitian terkait biologi. (CPL 01, CPL 08)
  4. Mahasiswa memahami konsep dasar penjajaran sekuen dan dapat mengaplikasikannya secara tepat. (CPL 01, CPL 08)
  5. Mahasiswa mampu membangun pohon filogenetik dan mengintepretasikan hasil konstruksi pohon. (CPL 01, CPL 08)
  6. Mahasiswa mampu memahami dan mengevaluasi relasi struktur dan fungsi dari suatu sekuens pada molekul RNA/Protein serta memprediksi stuktur protein. (CPL 08)
  7. Mahasiswa mampu menggunakan bahasa pemrograman berbasis linux, R dan Python dalam mengolah data terkait bioinformatika. (CPL 08, CPL 10)
  1. Students are able to apply their knowledge and practical skills in bioinformatics to solve biological problems. (CPL 01, CPL 13)
  2. Students are able to use a variety of bioinformatics analysis programs appropriately and apply them to relevant fields of biological research. (CPL 03, CPL 08, CPL 10, CPL 13)
  3. Students will be able to select and use DNA, RNA, protein, and metabolite databases and apply them to biology-related research. (CPL 01, CPL 08)
  4. Students understand the basic concepts of sequence alignment and can apply them correctly. (CPL 01, CPL 08)
  5. Students are able to construct phylogenetic trees and interpret the results of tree construction. (CPL 01, CPL 08)
  6. Students are able to understand and evaluate the structure-function relationship of a sequence in an RNA or protein molecule and predict protein structures. (CPL 08)
  7. Students are able to use Linux-based programming languages, R, and Python to process bioinformatics-related data. (CPL 08, CPL 10)
Metode PembelajaranProses belajar (ceramah dan diskusi) di dalam kelas, Penugasan terstruktur, Kegiatan mandiriIn-class learning activities (lectures and discussions), structured assignments, independent activities
Modalitas PembelajaranModa penyerapan: Visual, Auditorial Moda Pelaksanaan: Sinkronous dan AsinkronousLearning Styles: Visual, Auditory Delivery Methods: Synchronous and Asynchronous
Jenis NilaiABCDE
Metode PenilaianUTS 30%; UAS 30%; Praktikum 30%; kuis 5%; makalah dan presentasi proyek kelompok 5%Midterm Exam 30%; Final Exam 30%; Lab 30%; quizzes 5%; term paper and group project presentation 5%
Catatan Tambahan