Mata Kuliah BI2106 - 2024

Kode Mata KuliahBI2106 / 1 SKS
Penyelenggara106 - Biologi / SITH
KategoriKuliah
Bahasa IndonesiaEnglish
Nama Mata KuliahPraktikum Bioinformatika untuk BiologiIntroduction to Bioinformatics for Biologist Practicum
Bahan Kajian
  1. Pengantar Bioinformatika: Revolusi data biologi, big data, definisi bioinformatika
  2. Database dalam bioinformatika
  3. Penjajaran urutan DNA/protein
  4. Analisis filogenetika molekuler
  5. Anotasi genom dan prediksi struktur gen dan elemen regulator
  6. Analisis stuktur RNA dan prediksi struktur protein
  7. Analisis data bioinformatika menggunakan bahasa pemrograman Linux, R dan Phyton
  8. Kecerdasan buatan dalam bioinformatika
  1. Introduction to Bioinformatics: The Biological Data Revolution, Big Data, and the Definition of Bioinformatics
  2. Databases in Bioinformatics
  3. DNA/protein sequence alignment
  4. Molecular phylogenetic analysis
  5. Genome annotation and prediction of gene structures and regulatory elements
  6. RNA structure analysis and protein structure prediction
  7. Bioinformatics data analysis using the Linux, R, and Python programming languages
  8. Artificial Intelligence in Bioinformatics
Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK)
  1. Mahasiswa mampu menggunakan keilmuan dan kemampuan praktis bioinformatika dalam memecahkan masalah biologi.
  2. Mahasiswa mampu menggunakan berbagai macam program analisis bioinformatika dengan tepat dan dapat mengaplikasikan pada bidang terkait penelitian biologi.
  3. Mahasiswa memahami dapat memilih dan menggunakan database DNA, RNA, Protein dan Metabolit dan dapat mengaplikasikan pada penelitian terkait biologi.
  4. Mahasiswa memahami konsep dasar penjajaran sekuen dan dapat mengaplikasikannya secara tepat.
  5. Mahasiswa mampu membangun pohon filogenetik dan mengintepretasikan hasil konstruksi pohon.
  6. Mahasiswa mampu memahami dan mengevaluasi relasi struktur dan fungsi dari suatu sekuens pada molekul RNA/Protein serta memprediksi stuktur protein.
  7. Mahasiswa mampu menggunakan bahasa pemrograman berbasis linux, R dan Python dalam mengolah data terkait bioinformatika.
  8. Mahasiswa mampu mengolah dan menganalisis data bioinformatika menggunakan metode yang sesuai untuk memecahkan masalah biologi.
  9. Mahasiswa mampu mengevaluasi hasil analisis bioinformatika berdasarkan penalaran ilmiah dan bukti yang relevan.
  10. Mahasiswa mampu menerapkan metode dan perangkat bioinformatika untuk mendukung pengembangan teknologi dan penyelesaian permasalahan di bidang biologi serta bidang terkait.
  1. Students are able to apply their knowledge and practical skills in bioinformatics to solve biological problems.
  2. Students are able to use a variety of bioinformatics analysis programs appropriately and apply them to relevant fields of biological research.
  3. Students will be able to select and use DNA, RNA, protein, and metabolite databases and apply them to biology-related research.
  4. Students understand the basic concepts of sequence alignment and can apply them correctly.
  5. Students are able to construct phylogenetic trees and interpret the results of tree construction.
  6. Students are able to understand and evaluate the relationship between structure and function in RNA and protein sequences, as well as predict protein structures.
  7. Students are able to use Linux-based programming languages, R, and Python to process bioinformatics-related data.
  8. Students are able to process and analyze bioinformatics data using appropriate methods to solve biological problems.
  9. Students are able to evaluate bioinformatics analysis results based on scientific reasoning and relevant evidence.
  10. Students are able to apply bioinformatics methods and tools to support technological development and address problems in biology and related fields.
Metode PembelajaranProses belajar (ceramah dan diskusi) di dalam kelas, Penugasan terstruktur, Kegiatan mandiriIn-class learning activities (lectures and discussions), structured assignments, independent activities
Modalitas PembelajaranModa penyerapan: Visual, Auditorial Moda Pelaksanaan: Sinkronous dan AsinkronousLearning Styles: Visual, Auditory Delivery Methods: Synchronous and Asynchronous
Jenis NilaiABCDE
Metode PenilaianProject 25%, Laporan 50%, Kuis 10%, Tugas 10%, Kehadiran 5%Project 25%, Report 50%, Quiz 10%, Assignment 10%, Attendance 5%
Catatan Tambahan